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Table 3 Top 10 gene pairs for each genomic profile

From: Integrative network analysis for survival-associated gene-gene interactions across multiple genomic profiles in ovarian cancer

Genomic profile

Gene pair

Chromosome

Mutual information

p-value

mRNA

MYO3A

SWI5

10p11.1

9q34.13

0.1753

6.62E-05

CYTH3

ZC3H14

7p22.1

14q31.3

0.1710

8.70E-08

ARHGDIA

DNMBP

17q25.3

10q24.31

0.1688

1.81E-05

AK1

THBS1

9q34.1

15q15

0.1670

3.82E-07

MCM3

PCDHB5

6p12

5q31

0.1645

1.20E-05

CRYAB

TTPAL

11q22.3-q23.1

20q13.12

0.1627

1.57E-07

CYP39A1

NUAK1

6p21.1-p11.2

12q23.3

0.1627

2.01E-08

CMBL

KRT23

5p15.2

17q21.2

0.1624

1.67E-03

CYTH3

FBXW8

7p22.1

12q24.23

0.1616

4.66E-06

CYTH3

IDE

7p22.1

10q23-q25

0.1605

4.16E-08

CNA

SNRPB2

WSB2

20p12.1

12q24.23

0.1432

1.21E-04

KIF16B

WSB2

20p11.23

12q24.23

0.1411

1.52E-04

SNRPB2

TAOK3

20p12.1

12q

0.1377

1.70E-04

SNRPB2

TESC

20p12.1

12q24.22

0.1372

1.22E-04

PEBP1

SNRPB2

12q24

20p12.1

0.1370

1.70E-04

NOS1

SNRPB2

12q24.22

20p12.1

0.1367

1.22E-04

KIF16B

TAOK3

20p11.23

12q

0.1355

2.13E-04

KIF16B

TESC

20p11.23

12q24.22

0.1352

1.53E-04

KIF16B

PEBP1

20p11.23

12q24

0.1349

2.13E-04

FBXW8

SNRPB2

12q24.23

20p12.1

0.1348

1.87E-04

METH

F2RL3

SLC7A11

19p12

4q28-q32

0.1670

1.14E-04

CCM2L

TMEM129

20q11.21

4p16.3

0.1618

2.60E-04

CAND1

YTHDC1

12q14

4q13.3

0.1598

5.86E-04

ENSA

PTHLH

1q21.3

12p12.1-p11.2

0.1584

2.59E-06

CDH8

DYRK2

16q22.1

12q15

0.1582

5.08E-11

FOXL1

NRTN

16q24

19p13.3

0.1575

1.55E-07

FOLR2

TMEM129

11q13.3-q14.1

4p16.3

0.1570

1.04E-05

SYT8

ZBTB1

11p15.5

14q23.3

0.1566

1.91E-04

IL23A

ZBTB1

12q13.13

14q23.3

0.1559

3.62E-06

MFAP4

ZBTB1

17p11.2

14q23.3

0.1557

3.51E-05